Peterborough U21 er et engelsk fotballag som spiller i EFL Trophy. Laget er reserve-/ungdomslag for Peterborough United, som spiller i League One.

Peterborough U21 ble etablert i 1982 og har siden den gang deltatt i en rekke turneringer, inkludert Central League, Southern League og Premier League 2 Division 2. De har også deltatt i FA Youth Cup ved flere anledninger.

Laget har hatt en rekke suksesser, inkludert å vinne Central League-tittelen i 1989-90-sesongen og Premier League 2 Division 2-tittelen i 2018-19-sesongen. De har også nådd finalen i FA Youth Cup to ganger, i 1990-91 og 2001-02.

Flere av spillerne som har spilt for Peterborough U21 har gått videre til å spille for førstelaget til Peterborough United og andre profesjonelle klubber. Noen av de mest bemerkelsesverdige spillerne som har kommet gjennom klubbens ungdomssystem er George Boyd, Craig Mackail-Smith og Grant McCann.

Peterborough U21s hjemmebane er ABAX Stadium, som de deler med Peterborough United. Laget har et stort følge av unge fans og er kjent for sin underholdende spillestil.