Molepolole City FC er en fotballklubb fra Botswana som spiller i landets øverste divisjon, Botswana Premier League. Klubben ble grunnlagt i 1998 og har sitt hjemsted i Molepolole, som ligger sør for hovedstaden Gaborone.

Molepolole City FC har vunnet Botswana Premier League én gang, i 2016. De har også vunnet Botswana FA Cup to ganger, i 2015 og 2018.

Klubbens hjemmebane er Molepolole Stadium, som har en kapasitet på 3000 tilskuere.

Molepolole City FC har representert Botswana i afrikanske klubbturneringer flere ganger, men har aldri avansert til gruppespillet.

Noen av klubbens mest kjente spillere inkluderer Thato Bolweleng, Lesenye Selebogo og Thabang Sesinyi.